Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms