Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PROX2Q3B8N5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms