Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDRF1Q3B7T1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDRF1Q3B7T1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms