Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms