Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ISXQ2M1V0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms