Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPROQ16827 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPROQ16827 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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