Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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ME3Q16798 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME3Q16798 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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ME3Q16798 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME3Q16798 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
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