Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms