Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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