Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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