Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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