Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms