Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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RABEP1Q15276 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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