Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDCD1Q15116 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDCD1Q15116 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDCD1Q15116 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDCD1Q15116 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PDCD1Q15116 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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