Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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