Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE1CQ14123 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms