Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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