Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PKD2Q13563 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PKD2Q13563 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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