Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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MKRN4PQ13434 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN4PQ13434 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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