Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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ITGB3BPQ13352 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ITGB3BPQ13352 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ITGB3BPQ13352 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ITGB3BPQ13352 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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