Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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