Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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