Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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