Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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