Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms