Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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