Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C1Q12789 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms