Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms