Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms