Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms