Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms