Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms