Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms