Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms