Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms