Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB1Q02641 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms