Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms