Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms