Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms