Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL1Q00532 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms