Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms