Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX6P78412 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms