Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2BP67870 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms