Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms