Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP1S2P56377 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms