Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms