Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ELLP55199 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELLP55199 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms