Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms