Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRCA2P51587 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRCA2P51587 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms