Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETV1P50549 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETV1P50549 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms